Xcode8でLink error

Xcode8にしてから、Link errorに悩まされました。
テンプレートプロジェクトからSwift3のWatchOSアプリを作っているのですが、最初からエラーになってしまいます。

Alamofire4はSwift3に対応しているので、大丈夫な認識なのですが、
「alamofire compiled with older version of Swift language (2.0) than previous files (3.0)」
となります。

MacOS Sierraにしたり、色々したので、設定が壊れたのかと思い、しばらく悩みました。
なんとか解決したのですが、推奨できる内容ではないかもしれませんので、自己責任でお願いします。

1. Cocoapodsを1.1.0-rc2にアップデート。cocoapod 1.0.1を使っていましたが、Xcode8に対応していないようです。ベータ版ですが、アップデートしました。

2. /Users/ユーザ名/Library/Developer/Xcode/DerivedData/ 配下を削除。消してよいのかちょっと疑問でしたが、キャッシュ系のようだと理解して削除しました。

1.2.の手順でなんとかビルドできるようになりました。